Setelah mencapai Samudra Pasifik pada November 1805, korps mendirikan Fort Clatsop, dekat Astoria, Oregon, sebagai tempat musim dinginnya. Kemudian, pada tanggal 23 Maret 1806, penjelajah yang lelah menuju ke rumah dan St. Louis. Mereka mengambil kuda-kuda mereka dari suku Nez Percé Indian dan melintasi Pegunungan Bitterroot. Ekspedisi dipisahkan menjadi dua pihak di dekat Lolo hari ini, Idaho, untuk menjelajahi negara lebih menyeluruh dalam perjalanan pulang; kelompok akan terpisah lebih dari sebulan. Selama waktu itu, kompi Lewis diserang oleh pejuang Blackfoot, dua di antaranya terbunuh dalam pertempuran, satu-satunya ekspedisi yang merupakan pertumpahan darah. Tak lama kemudian, pribadi yang setengah buta, Pierre Cruzatte mengira Lewis adalah rusa dan menembaknya di paha. Pada saat Lewis bersatu kembali dengan Clark, kakinya hampir sembuh. Menjangkau St. Louis pada 23 September 1806, Clark mencatat, "Kami disambut oleh semua penduduk desa dan menerima sambutan hangat." Perjalanan 8.000 mil korps sudah berakhir.
Sersan John Ordway
Sersan Ordway, salah satu anggota asli korps, telah membantu mengatur perkemahan musim dingin pertama ekspedisi di dekat St. Louis. Seperti sersan-sersan lainnya, Ordway membuat jurnal, tetapi dia satu-satunya yang mencatat entri harian. Pada tanggal 21 September 1806, ketika korps mencapai St. Charles (di Missouri sekarang), Ordway menulis: "Menjelang malam kami tiba di St. Charles menembakkan tiga putaran dan berkemah di ujung bawah Kota. Orang-orang dari Town berkumpul di tepi sungai dan hampir tidak bisa percaya bahwa itu adalah kami karena mereka telah mendengar dan percaya bahwa kami semua mati dan dilupakan. "
Musim gugur itu, Ordway juga menemani Lewis dan delegasi Mandan dan Osage Indian ke Washington, DC untuk membahas perdagangan AS di masa depan dengan suku-suku ini. Dia kemudian menjual jurnalnya ke Lewis dan Clark seharga $ 300, dan pindah ke Wilayah Missouri, tempat dia menikah dan mulai bertani di dekat New Madrid. Pada bulan Desember 1811 tiga gempa bumi besar melanda daerah tersebut; antara 500 dan 1.000 orang tewas. Pada saat gempa kelima melanda, 7 Februari 1812, hampir tidak ada rumah yang tetap berdiri, dan New Madrid menjadi kota hantu. Hanya sedikit yang diketahui tentang Ordway setelah ini; para sarjana berspekulasi tanah pertaniannya mungkin telah dibuat tidak berguna dari gempa bumi dan bahwa dia mati dalam kemiskinan.
Kapten Meriwether Lewis
Pada tanggal 23 September 1806, Lewis menulis kepada Presiden Jefferson: "Dengan senang hati saya mengumumkan kepada Anda kedatangan aman dari saya dan pihak .... Dalam kepatuhan terhadap perintah Anda, kami telah mempidanakan Benua Amerika Utara ke Samudra Pasifik, dan cukup mengeksplorasi bagian dalam negeri untuk menegaskan dengan keyakinan bahwa kami telah menemukan kekalahan yang paling praktis yang ada di seluruh benua melalui cabang-cabang Sungai Missouri dan Columbia yang dapat dilayari. "
Baik Lewis maupun Clark diberi imbalan dengan murah hati atas layanan mereka, masing-masing menerima bidang tanah yang luas dan gaji ganda. Presiden Jefferson menunjuk gubernur Lewis Wilayah Louisiana Atas pada Maret 1807; entah kenapa, Lewis menunggu setahun sebelum pergi ke St. Louis untuk mengambil tugas barunya. Sesampai di sana, ia berhutang budi dengan membeli tanah dan menyiapkan jurnal ekspedisi untuk dipublikasikan. Presiden James Madison, yang telah menggantikan Jefferson, menolak untuk mengganti dia atas uang pengeluaran yang dia minta untuk mengembalikan delegasi Mandan dan Osage ke tanah air mereka, dan Sekretaris Perang William Eustis mengisyaratkan bahwa Lewis akan mendapat untung dari dana tersebut. Pada bulan Agustus 1809, seorang Lewis yang tertekan menulis kepada Eustis: "Saya tidak pernah menerima sepeser pun uang publik .... Saya telah diberi tahu. Perwakilan telah dilakukan terhadap saya, —semua yang saya inginkan adalah Investigasi yang lengkap dan adil." Pada akhir 1809, Lewis meninggalkan St. Louis ke Washington, DC untuk membersihkan namanya. Sangat tertekan, Lewis mencoba bunuh diri dua kali dalam perjalanan. Setelah tiba di sebuah rumah singgah di Tennessee pada 10 Oktober, penjelajah berusia 35 tahun itu mengakhiri hidupnya dengan menembak dirinya sendiri dengan dua pistol.
James Neelly, agen India untuk Chickasaw Nation, segera menulis kepada Thomas Jefferson: "Dengan rasa sakit yang luar biasa saya harus memberi tahu Anda tentang kematian Yang Mulia Meriwether Lewis, Gubernur Louisiana atas yang meninggal pada pagi hari ke-11 Instan dan saya minta maaf untuk mengatakan dengan Bunuh Diri .... [Saya] telah membuatnya terkubur dengan sebaik mungkin di tempat itu — jika ada yang ingin dilakukan teman-temannya di makamnya, saya akan mengikuti Instruksi mereka. "
Setelah kematian Lewis, pemerintahan Madison setuju untuk membayar saldo tagihan yang disengketakan.
Kapten William Clark
Meskipun Clark tidak mendapatkan komisi kapten yang direkomendasikan Lewis, Clark diberikan dua penunjukan: brigadir jenderal milisi, dan pengawas urusan India untuk Wilayah Louisiana Atas. Pada tahun 1813 ia diangkat menjadi gubernur Wilayah Missouri, posisi yang dipegangnya hingga 1820. Setelah kematian Lewis, jurnal ekspedisi dikirim ke Clark, yang menyerahkannya kepada editor Nicholas Biddle. Jurnal dua jilid disajikan kepada publik pada tahun 1814, sepuluh tahun setelah korps memulai perjalanan epiknya; publikasi mereka menyebabkan sedikit kehebohan.
Penulis biografi Clark Landon Y. Jones mencatat: "Selama 30 tahun setelah ekspedisi, William Clark mendapat peringkat sebagai pejabat federal terkemuka di Barat, orang penting untuk enam Presiden, dari Jefferson hingga Van Buren, yang mempercayainya dengan melindungi kepentingan Amerika di wilayah diperebutkan oleh Inggris dan Spanyol. " Clark mewujudkan kontradiksi pada masanya; sementara dia mendesak pemerintah untuk memperlakukan orang India dengan adil, perjanjian yang ditengahinya memaksa relokasi puluhan ribu orang. Clark meninggal pada usia 68, pada tahun 1838, di rumah St. Louis putra sulungnya, Meriwether Lewis Clark.
Sacagawea
Tujuh tahun setelah reuni dengan Shoshone, Sacagawea dan suaminya muncul di Fort Manuel, sebuah pos perdagangan dekat Bismark, Dakota Utara, di mana Toussaint telah menemukan pekerjaan sebagai juru bahasa di Perusahaan Bulu Missouri. Wartawan Henry Brackenridge menulis bahwa Sacagawea sakit "dan ingin mengunjungi negara asalnya." Dia tidak pernah mendapat kesempatan. Pada 20 Desember 1812, John Luttig, kepala juru tulis benteng, menulis dalam buku catatannya bahwa Sacagawea "meninggal karena demam busuk dia adalah wanita yang baik dan terbaik di benteng." Dia akan berusia sekitar 25 tahun. Dia meninggalkan dua anak kandung: Jean Baptiste yang berusia 7 tahun dan Lisette yang berusia 4 bulan.
Tahun berikutnya Luttig, mungkin mewakili William Clark (yang telah bekerja padanya), mengajukan petisi ke Pengadilan Anak Yatim di St. Louis untuk perwalian Jean Baptiste dan Lisette. (Pada saat itu, Toussaint dianggap mati, setelah tidak terlihat selama enam bulan.) Nama Luttig akhirnya dicoret pada petisi dan diganti dengan Clark, yang, paling tidak, dibayar untuk pendidikan Baptiste. (Baptiste kemudian melakukan perjalanan ke Eropa, di mana ia tinggal selama enam tahun. Setelah kembali ke Amerika Serikat, ia bekerja sebagai penjebak dengan Jim Bridger dan Kit Carson.) Nasib Lisette, dan keponakan Sacagawea, tidak diketahui.
Jean Baptiste
Selama ekspedisi, William Clark sangat menyukai bayi Sacagawea, menjadi wali dan kemudian membiayai pendidikannya di sekolah asrama St. Louis.
Fakta yang diketahui tentang kehidupan Baptiste hanya sedikit. Pada tahun 1823, Adipati Paul Wilhelm Friedrich Herzog dari Wurttemberg, Jerman, mengunjungi sebuah pos perdagangan di Kansas City saat ini, di mana ia bertemu dengan lelaki berusia 18 tahun itu, yang bekerja sebagai pemandu dan penerjemah. Keduanya pergi ke Eropa, tempat Baptiste tinggal selama enam tahun. Dia ayah seorang anak dengan seorang wanita Jerman, tetapi bayi itu, seorang anak laki-laki, meninggal setelah tiga bulan, dan Baptiste kembali ke Amerika Serikat. Dia menuju Barat, akhirnya bekerja sebagai penjebak dengan Jim Bridger dan Kit Carson.
Baptiste menetap di California, melayani sebagai alcalde, atau hakim, di Misi San Luis Rey. Pada tahun 1866, ia bergabung dengan para pencari emas yang menuju ke Wilayah Montana. Di perjalanan, ia terserang radang paru-paru dan meninggal tak lama kemudian, pada usia 61, di Oregon dekat perbatasan Idaho, setelah hidup lebih lama dari semua anggota ekspedisi kecuali Sersan. Patrick Gass.
York
Setelah ekspedisi berakhir, Clark melakukan perjalanan pada tahun 1807 ke St. Louis untuk mengambil tugas sebagai kepala agen India untuk Wilayah Louisiana Atas, membawa York bersamanya. Terjadi keretakan di antara kedua lelaki itu: York ingin tetap di Kentucky, dekat istrinya, yang hampir lima tahun tidak dilihatnya. Dia juga mengajukan petisi kepada Clark untuk kebebasannya — mungkin memikirkan gaji dua kali lipat dan 320 hektar yang diterima orang-orang lain atas jasa mereka dalam ekspedisi. Permintaan ini menurut Clark sebagai lancang datang dari seorang budak. Clark akhirnya mengizinkan York untuk kembali ke Kentucky pada tahun 1808 untuk kunjungan singkat. Tetapi Clark menulis kepada saudaranya, Jonathan: "Jika ada upaya yang dilakukan oleh york untuk melarikan diri, atau menolak untuk memprovokasi tugasnya sebagai Budak, saya berharap dia dikirim ke New Orleans dan Sold, atau disewa untuk master parah sampai dia berpikir lebih baik dari Perilaku Seperti itu. "
Dalam sebuah surat (sekarang di Jonathan Clark Papers — Koleksi Temple Bodley di Filson Historical Society di Louisville) kepada saudara lelakinya yang berkencan beberapa bulan kemudian, Clark menulis: "Aku memang ingin melakukannya dengan baik kepadanya — tetapi karena dia telah mendapatkan demikian sebuah gagasan tentang kebebasan dan Layanan emeninya, bahwa saya tidak berharap dia akan menjadi banyak Layanan bagi saya lagi; Saya tidak berpikir dengannya, bahwa Layanannya telah begitu besar (atau Situasi saya akan menjanjikan saya untuk membebaskannya). "
York kembali ke St. Louis pada awal 1809, tetapi Clark masih memandangnya dengan tidak baik. "Dia ada di sini, tetapi hanya sedikit Layanan bagi saya, " Clark menulis kepada Jonathan. "[York] kurang ajar dan Sulky, aku memberinya Parah memukul hari lain dan dia telah banyak memperbaiki Sence."
Penyebutan terakhir York dalam surat William Clark muncul pada bulan Agustus 1809; Clark sangat tidak senang dengannya sehingga dia memutuskan untuk mempekerjakannya atau menjualnya. John O'Fallon, keponakan Clark, menulis pada tahun 1811: "Istilah yang [York] disewa untuk Tn. Young kemarin berakhir tetapi saya percaya setuju untuk meminta Tn. Fitzhugh telah kembali mempekerjakannya ke Tn. Mitchell yang tinggal sekitar tujuh mil dari tempat ini .... Aku tahu bahwa dia telah berpakaian acuh tak acuh jika oleh Young .... "O'Fallon lebih lanjut mencatat bahwa istri York telah pindah dengan tuannya dan sisa rumah tangganya ke Mississippi; tidak mungkin York dan istrinya bertemu lagi. Sepuluh tahun setelah ekspedisi berakhir, York masih diperbudak, bekerja sebagai wagoner untuk keluarga Clark.
Pada tahun 1832, penulis Washington Irving mewawancarai Clark dan menanyakan nasib York. Clark menjawab bahwa dia akhirnya membebaskan York dan berkata, dengan mengejutkan, bahwa mantan budaknya tidak senang dengan kebebasannya dan mencoba untuk kembali ke Clark — sekarat karena kolera di sepanjang jalan.
Tapi benarkah? Pada tahun 1832, pedagang bulu Zenas Leonard, mengunjungi desa Crow di Wyoming tengah-utara, "menemukan seorang lelaki Negro, yang memberi tahu kami bahwa ia pertama kali datang ke negara ini bersama Lewis dan Clark — yang dengannya ia juga kembali ke negara bagian Missouri, dan dalam beberapa tahun kembali lagi dengan Tuan Mackinney, seorang pedagang di sungai Missouri, dan tetap di sini sejak — yaitu sekitar sepuluh atau dua belas tahun. "
Pada 17 Januari 2001, Presiden Clinton mempromosikan York secara anumerta ke pangkat sersan kehormatan, Tentara Reguler.
