Ginkgo Bioworks dikelola oleh peretas. Meskipun mereka lebih suka mengatakan bahwa mereka "mendesain organisme, " para karyawan telah membangun laboratorium, atau "pengecoran, " di Boston, tempat mereka meretas biologi. Mereka membelah gen, kemudian memasukkan campuran gen ke dalam ragi ragi, untuk dengan cepat menumbuhkan organisme sintetis yang melayani kebutuhan manusia .
Direktur kreatif Gingko, Christina Agapakis, mengatakan mereka pada dasarnya dalam bisnis mempercepat evolusi. "Ini seperti pabrik pembuatan prototipe cepat, " katanya.
Para biohackers bekerja membangun organisme yang menangkap karbon dan lainnya yang menanam probiotik yang membantu orang melawan infeksi. Perusahaan menerima dana awal dari DARPA untuk mengembangkan yang terakhir. Tetapi saat ini, Gingko menciptakan organisme yang mengeluarkan bau tertentu. Tujuannya adalah untuk memproduksi aroma dan rasa sintetis secara massal yang dapat digunakan untuk apa saja, mulai dari parfum hingga pemanis buatan. Ini adalah langkah untuk berpotensi menggantikan senyawa organik langka, mahal, tumbuh lambat atau mudah menguap. Robertet, sebuah perusahaan wewangian Prancis, menugaskan Gingko untuk membantu mensintesis aroma dari mawar tertentu, hanya tumbuh di Turki dan Bulgaria, yang diambil dengan susah payah dengan tangan.
"Aroma telah menjadi petunjuk karena aroma menggunakan kimia dari sesuatu yang dimulai sebagai ekstrak biologis, " katanya. "Jadi kami mencari di mana biologi bisa kembali ke teknik kimia dan membuatnya berkelanjutan dan terbarukan."
Baru-baru ini saya berbicara dengan Agapakis tentang perusahaan dan misinya:
Bagaimana Ginkgo memulainya?
Ginkgo didirikan pada 2008 oleh Tom Knight dan empat pria (Reshma Shetty, Jason Kelly, Barry Canton, Austin Ch) yang baru saja menyelesaikan gelar PhD di MIT. Tom memiliki andil dalam mengembangkan ARPANET, pendahulu Internet, tetapi pada akhir 90-an, ia memutuskan bahwa komputer itu membosankan dan pemrograman biologi itu menarik. Dia ingin melihat di mana teknik dan biologi bisa bersinggungan. Itulah inti dari Ginkgo. Para pendiri ingin membuat biologi lebih mudah untuk direkayasa, dan kemudian untuk melihat apa artinya bagi industri dan teknologi.
Mengapa ini terjadi sekarang?
Ketika mereka mulai pada tahun 2008, itu hanya tentang waktu ketika biaya urutan DNA benar-benar turun dengan cepat, dan karena itu orang mulai mengurutkan semuanya. Pengetahuan tentang bagaimana evolusi memecahkan masalah telah berkembang pesat, dan orang-orang telah merangkai semua jenis genom dan enzim. Itu telah menjadi sumber daya atau perpustakaan.
Sisi lain adalah sintesis. Anda dulu harus menemukan organisme, dan sekarang Anda dapat mensintesis gen dari basis data. Ketika saya masih mahasiswa, biayanya $ 1 per pasangan basa, jadi satu gen biaya satu hingga $ 5.000 dolar. Sekarang menjadi uang per basis. Kami baru saja memesan 100 juta pasangan basa dari Twist [sebuah perusahaan DNA sintetis], yang cukup untuk menulis genom ragi 10 kali. Itu menjadi jauh lebih mungkin.
Christina Agapakis, direktur kreatif di Ginkgo Bioworks (Foto oleh Thatcher Cook for PopTech) Apa yang sebenarnya Anda lakukan di lab?
Ini seperti pabrik pembuatan prototipe cepat. Kita dapat menjalankan banyak varian jalur berbeda dan melihat apa yang berfungsi dalam kombinasi yang tepat.
Terkadang proyek kami dimulai dengan pelanggan kami. Mereka akan berkata, "Sulit bagi kami untuk membuat bahan ini, " dan kami akan mulai mencari organisme yang akan menghasilkan sesuatu untuk mereka. Kita mulai dari biokimia. Kami memiliki insinyur teknologi yang memahami biologi sel, dan semua metabolit yang ada di sana, sehingga mereka memahami bagaimana prosesnya memengaruhi sel.
Jenis proyek lain melihat apa yang dapat dilakukan biologi di ruang kimia. [Di sinilah Ginkgo berada menumbuhkan mikroba untuk meniru aroma mawar yang sulit tumbuh itu.] Untuk bahan-bahan yang kita lihat sekarang, atau bunga atau tanaman pada umumnya, ada beberapa kelas bahan kimia yang dapat membuat sel berbeda. Ada yang mengatakan 1.000 hingga 5.000 enzim berbeda. Kami akan mengatakan, mari kita sintesiskan dan masukkan ke dalam ragi dan lihat apa yang dilakukan varian.
Mengapa Anda menggunakan ragi sebagai bahan dasarnya?
Ragi itu luar biasa, karena kita sebagai manusia sangat pandai meragi ragi. Ada banyak teknologi di sekitar kemampuan ragi untuk menciptakan rasa dan aroma, karena bir. Apa yang kami lakukan adalah campuran yang sangat keren dari sains kontemporer dan metode pembuatan bir tradisional. Kepala fermentasi kami sebenarnya memiliki tempat pembuatan bir — Mystic Brewery di Chelsea [Massachusetts].
Keuntungan dari pengecoran adalah ia dapat mengotomatiskan pengurutan. (Ginkgo Bioworks) Apa yang Anda kerjakan sekarang?
Ada diagram Venn yang terus berkembang tentang di mana letak kemampuan biologi, di mana teknik itu layak dan di mana ada industri, kebutuhan, dan teknologi. Fragrance telah menjadi pemimpin, tetapi kami juga bekerja pada teknologi untuk menangkap karbon. Kami mendapat hibah Badan Penelitian Proyek-Energi (ARPA-E) Lanjutan untuk melihat penangkapan karbon dan mengubah karbon rantai pendek menjadi hal-hal yang lebih kompleks. Kami juga bekerja sama dengan Ajinomoto, perusahaan makanan dan kimia Jepang, untuk melihat apakah kami dapat menemukan cara untuk meningkatkan aliran limbah mereka.
Apa yang terjadi selanjutnya?
Bioworks 2, sebuah pengecoran yang diperluas, dibuka pada musim semi atau awal musim panas tahun depan, dan pengecoran tersebut terus-menerus berubah. Kami selalu berpikir tentang desain organisme dan cara menjalankannya dengan lebih efisien. Kami membawa proyek, pelanggan, dan pasar baru, tetapi kami juga sedang mengerjakan teknologi.
Sepuluh tahun yang lalu, kami melihat komunitas mikrobioma, mikroba, dan bagaimana kami bisa merekayasa mikroba. Saya menantikan saat ketika kita tahu bagaimana mikroba bekerja bersama. Kami juga memikirkan semua hal yang berbau. Suatu hari kita ingin memiliki sesuatu yang disebut "100 vial." Akan ada 100 aroma berbeda yang diciptakan melalui alam.
